防腐问题是散热器质量好坏的关键。普通钢质散热器如未加防腐处理，怕氧化腐蚀，停暖时一定要满水保养，防止空气进入；铝质散热器则怕碱性水腐蚀。一般来讲，铜比钢的耐腐蚀性能要好。传统铸铁散热器不易被腐蚀损坏，因为铸铁本身抗氧化腐蚀的性能好。近年来，国内一些小厂家试图通过加大壁厚来解决钢质散热器的防腐问题，这是完全错误的。因为钢质散热器的腐蚀均为小孔局部腐蚀，而不是均匀腐蚀。
由于材质的腐蚀原理不同，铝质散热器虽然不怕酸腐蚀(氧化腐蚀)，但却容易发生碱腐蚀和氯离子腐蚀。
由于铝合金的焊接性能差，建议消费者避免选用带焊缝的铝合金散热器，而选购全压铸的铝合金散热器。另外，由于铝合金散热器对水质的要求与钢不一样，所以避免铝合金散热器与其他材料混合安装。